羊肚菌的营养价值堪比肉类、乳制品和鱼类，很多营养素甚至高于肉类几倍甚至几十倍之多，故可见羊肚菌的营养价值之高。
根据相关测定每100克羊肚菌营养素含量：可食部分34%，水分74.2克，蛋白质21.5克，脂肪2.5克，糖0.7克，热量111千卡，钙11毫克，磷190毫克，铁1.5毫克，胡萝卜素0，硫胺素0.03毫克，核黄素0.09毫克，尼克酸8.0毫克，维生素C-，维生素A-，粗纤维0，灰分1.1克。
例如核黄素，核黄素能参与体内生物氧化反应与能量代谢，可提高肌体对蛋白质的利用率，促进生长发育，维护皮肤和细胞膜的完整性。当缺乏时，就影响机体的生物氧化，使代谢发生障碍。其病变多表现为如口角炎、唇炎、舌炎、眼结膜炎和阴囊炎等。成人每日只需食用3-4只羊肚菌便可补足所需。
此外，羊肚菌富含18种氨基酸，其中所含的8种氨基酸是人体不能制造的“必需氨基酸”。羊肚菌所含的硒是人体红细胞谷胱甘肽过氧化酶的组成成分，可运输氧分子来抑制恶性肿瘤，另方面能加强维生素E的抗氧化作用，使致癌物的方向改变，从而减少或消除致癌的危险。
