牡蛎粉虽然功效众多，但是干吃需要在医生指导下用药，以免产生不良的的反应，不利于牡蛎粉发挥药效以及身体的恢复。通常情况下牡蛎粉可以用酒、温水、汤等送服。
1、心脾气痛，有痰。用牡蛎煅成粉，酒送服二钱。
2、疟疾寒热。用牡蛎粉、杜仲，等分为末，加蜜做成丸子，如梧子大。每服五十丸，温水送下。
3、气虚盗汗。用牡蛎粉、杜仲，等分为末。每服一匙，酒送下。
4、产后盗汗。用牡蛎粉、麦麸（炒黄）等分。每服一钱，猪肉汤调下。
5、消渴饮水。用黄泥封固牡蛎，煅赤，研为末。每服一钱，活鲫鱼煎汤调下。
除了口服，牡蛎粉也可以同其他的药物搭配用来外敷治疗。
1、阴囊水肿用牡蛎煅粉二两、干姜（炮）一两，共研为末，冷水调糊敷上。不久，囊热如火。药干即换，至小便通畅末，冷水调糊敷上。不久，囊热如火。药干即换，至小便通畅为愈。又方：改冷水调糊为葱汁，白面同调。不儿不用干姜。
2、刀伤出血。用牡蛎粉敷涂。
3、痈肿初起。用牡蛎粉末调水涂搽。药干即换。
