肛门血栓不存在最快的消除方法，具体治疗方法要根据病情轻重程度来决定。可以从药物治疗或是手术治疗进行消除。
肛门血栓即血栓性外痔，治疗方法主要为服用一些促进局部血液循环的药物，如地奥司明片、消脱止片。或是局部外涂药物，如龙血竭或云南白药喷雾。也可以采取中药熏洗方式，能够帮助症状得到改善。
血栓性外痔可能导致疼痛，尤其急性血栓性外痔，会出现疼痛难忍的情况，如果药物治疗没有达到好的作用，就需要考虑手术治疗。
