肺部真菌感染会复发，而复发原因多与治疗不规范、理化因素刺激、抵抗力下降等因素有关。
1、治疗不规范
肺部真菌感染与其他肺部疾病相似，以药物治疗为主。用药治疗期间应遵守足量、足疗程、规范、联合用药，病情可逐渐控制，感染性症状逐渐消失。若治疗不规范，致病菌依然存在，适宜条件下可再次发病。
2、理化因素刺激
理化因素刺激也是诱发肺部真菌感染和复发的主要原因，不可忽视。病情痊愈后，应避免理化因素刺激，降低复发率。
3、抵抗力下降
抗真菌感染治疗能消除真菌感染性症状，有利于肺部功能恢复。但是，肺部一些隐藏性真菌并未完全消除。抵抗力低下时为消除病菌活跃性增强，诱发病情反复发作。
