肺部真菌感染致病菌为：肺隐球菌、念珠菌、曲菌，不同致病菌感染途径有所不同。
1、肺隐球菌感染
肺隐球菌多存在土壤、鸟类粪便中，也可见于水果、蔬菜、空气，主要传播途径为呼吸道传播，新型隐球菌孢子被吸入肺内大量繁殖，引起肺部真菌感染。
2、肺内念珠菌感染
念珠菌存在于自然界中，也存在于哺乳动物或鸟禽排泄物。与人体接触，可寄生于人体皮肤、口腔、肠胃道、消化道、阴道等部位，属于特殊性机会致病菌。感染通过口腔直接蔓延或经血行播散全身其它器官。
3、肺内曲菌感染
曲霉菌感染传播途径为：呼吸道吸入、侵入血液播散至全身各个部位、器官。
