空肠弯曲菌肠炎潜伏期1~10天，平均5天，食物中毒型潜伏期仅20小时。早期有头痛、发烧、肌肉酸痛等前驱症状，随后出現拉肚子、恶心呕吐，突发者开始发烧、拉肚子。
发热患者约占56.3~60%，一般低至中度发热，体温38℃左右，个别高热达40℃，全身不适，儿童高热伴痉挛。腹痛、腹泻是最常见的症状，表现为整个腹部或右下腹痉挛性绞痛，剧者如急腹症，但罕见的反跳痛，腹泻占91.9%。
一般最初是水样稀薄的便，然后是粘液和脓血粘液的便，明显的血便，腹泻次数多为4~5次，频率达到20次以上，病变累及直肠和乙状结肠者，内急后重，多在1周内自我治愈。轻者24小时治愈，与病毒性胃肠炎难以区别的20%患者病情延伸，间歇性腹泻持续2~3周，治愈后复发或变重。
