从控制感染源、切断感染途径、提高人体抵抗力三个方面着手:
1、初期:发现患者和有菌者，及时隔离和彻底治疗是控制菌病的重要措施。从事餐饮业、保育和水厂工作的人需要长期追踪，必须暂时离开工作岗位。
2、切断：传播途径搞好“三管一灭”即管好水、粪和饮食以及消灭苍蝇），养成饭前便后洗后的习惯。对餐饮行业、儿童机构工作人员定期检查带菌状态。发现有菌的人，应立即治疗和离开工作。
3、保护：易感人群可口服依莲菌株活菌苗，该菌无致病力，但有保护效果，保护率达85%～100%。国内已生产多价痢疾活菌苗。
