慢性尿道炎或膀胱炎：其临床表现与慢性前列腺炎相似，但前列腺检查无异常发现。
2、前列腺疼痛：无实质性病变，表现为会阴、耻骨疼痛、压痛、排尿障碍等尿路表现。前列腺触诊正常，前列腺液镜检查正常，前列腺液和尿培养无细菌。
3.肉芽肿性前列腺炎，虽然症状和直肠指检容易与慢性前列腺炎混淆，但前者进展迅速，尿潴留快，短期内硬结生长快。前列腺活体组织需要检查鉴别，组织学检查表现为肉芽肿反应。
4、卡他性前列腺炎或前列腺疾病（也称非细菌性前列腺炎）的临床症状与慢性前列腺炎难以区分。会阴疼痛、不适、排尿和性功能障碍。前列腺液检查有大量的卵磷脂体，白细胞增多，但涂片和细菌培养没有细菌生长。
5.前列腺溢液(又称无菌性前列腺炎、前列腺泄漏或慢性前列腺充血):乳白色分泌物从尿道流出，常伴有精神症状。但直肠指检和前列腺液镜检查正常，细菌学检查为阴性。
6.前列腺癌:晚期可出现尿路症状。直肠检查发现前列腺有硬肿块，表面不均匀。癌细胞可以在前列腺液涂片和穿刺活检中找到。
7、前列腺结石：腰骶、会阴疼痛、阳痿、早泄等性功能障碍。直肠检查可触及前列腺结石摩擦、骨盆X线平片有阳性结石阴影，可识别。
8、前列腺结核。症状与前列腺炎相似，但有结核病史。直肠指检前列腺呈不规则结节状，附睾肿大变硬，输精管有串珠状硬结。前列腺液结核杆菌直接涂片或结核杆菌培养可以找到结核杆菌，前列腺活体组织检查可见结核结节或干酶样坏死。
