芡实有着许多独特的疗效，但是它毕竟是一种药材，是药三分毒。芡实的副作用主要体现在它固涩收敛的作用。古书《随息居饮食谱》记载了芡实的食用宜忌:“凡外感前后,疟痢疳痔,气郁痞胀,溺赤便秘,食不运化及新产后皆忌之。”所以，大便硬化者、便秘者、平时有腹胀症状、消化不良者、产妇新产过后都不宜食用芡实。
虽然芡实含有如碳水化合物、脂肪、蛋白质、粗纤维、钙、磷、铁等营养成分，常吃对身体有益，但一般人也不适宜将它当主粮食用。此外，市面上的芡实主要有生用和炒用两种，两者的作用也不一样，生芡实以补肾为主，而炒芡实主要作用是健脾开胃。炒芡实一般来说不适合在家自己炒制，因为在炒制的过程中要加入麦麸并掌握一定的火候，所以一般从药店购买。
妈网百科提醒，无论是生食还是熟食，芡实一次切忌食用过多，否则难以消化。
