做俯卧撑后腋窝附近疼可能是因为乳酸堆积或肌肉纤维破损导致。
俯卧撑属于无氧运动，也称为阻力运动，如果之前的运动量较少，突然做俯卧撑这种无氧运动，身体会消耗比较多的热量，这时会代谢体内多余的卡路里而产生乳酸、乙酸，乳酸和乙酸在骨骼肌内蓄积，就会出现肌肉酸疼。从而出现酸痛。
胸肌是非常大的一块肌肉，会一直延伸到腋下，做俯卧撑时会反复刺激胸肌，导致胸肌的肌肉纤维破损，甚至出现发炎，但是这属于增肌的过程中不可避免的。因此，肌肉纤维的破损本身就是做俯卧撑锻炼所追求的，所以肌肉纤维的轻微破损并不严重，并且无法避免。
