新冠疫苗是指新型冠状病毒疫苗。扁平疣可以采用局部外用药物治疗及物理治疗，常用药物包括水杨酸、干扰素凝胶、免疫制剂等，因其所服用的药物中，有符合新型冠状病毒疫苗打禁忌证，建议在疾病急性发作期、服药期间禁止打新型冠状病毒疫苗，病情稳定的情况下可正常打。
新型冠状病毒疫苗属于最新研发的灭活性疫苗，因临床应用时间较短，还存在着许多未知的风险。如果患有某些疾病，不允许打新型冠状病毒疫苗。而扁平疣是因HPV感染所引起的病毒性皮肤疾病，其主要传播方式为直接接触或间接接触。
新型冠状病毒疫苗的禁忌证中，没有明确指出患有扁平疣的患者不能打新型冠状病毒疫苗，但因扁平疣治疗需采用药物治疗，所以在疾病急性发作期或服药期间，尽量避免打新型冠状病毒疫苗，防止新型冠状病毒疫苗与药物产生相互作用，影响新型冠状病毒疫苗的效果及加重身体不适症状，稳定期可正常打。
