皮脂腺囊肿不能自愈，不具有自愈性，否则有恶变倾向。应及时通过手术切除、物理性疗法、药物疗法等方法及时治疗。
1、手术切除
皮脂腺囊肿可在局部麻醉下行手术切除术，切除时尽量将囊肿完全摘除，避免残留囊壁而再次复发。
2、物理性疗法
物理性疗法主要包括激光治疗、冷冻治疗、电离子微创治疗等。这些疗法适合于胃合并感染性囊肿者。具有操作简单，切口小、出血少、复发率低等优势，治疗后不用缝合，不会留下难看疤痕。
3、药物疗法
药物疗法以外用、口服药物相结合应用，在减轻局部炎症反应，避免感染同时消除诱因，避免病情进一步加重。而药物疗法应用疗程过长，一般需要2~3周左右方可见效。
