扁桃体发炎时最好暂缓接种疫苗，否则可能使身体不适症状加重，还会影响疫苗的接种效果。
疫苗的种类很多，大多为灭活疫苗或减毒疫苗，在机体免疫力下降时暂缓接种疫苗，否则会影响疫苗在体内形成抗体，严重时会导致疫苗接种失败。扁桃体发炎期间，机体免疫力较差，建议暂缓接种疫苗。如应用清热解毒、对抗病毒的药物治疗扁桃体炎，也可能会因药物影响抗体的形成。
扁桃体发炎时，许多患者有发烧症状，这是接种疫苗的禁忌。如盲目接种疫苗，不但影响疫苗接种效果，还可能使发烧等身体不适症状加重，影响疾病的恢复。这也会干扰医生的判断，无法明确身体不适是疾病引起的，还是疫苗接种引起的。
扁桃体发炎后积极治疗，大多一周左右可治愈，所以可等待疾病治愈后再接种疫苗。
