慢性扁桃体炎患者由于扁桃体内细菌不易清除，身体抵抗力变差，及鼻炎、鼻窦炎存在，扁桃体炎易反复发作。复发频繁者，应考虑手术切除扁桃体。
慢性扁桃体炎易复发。若患者身体免疫力较低，易发生感冒，感冒引起慢性扁桃体炎急性发作，出现咽痛、扁桃体脓肿等症状。扁桃体内细菌不易彻底清除，受外界刺激后易复发。存在鼻炎、鼻窦炎也是其复发常见原因。
疾病反复发作可引起肾炎、风湿性关节炎、心肌炎等免疫性疾病，若每年发作次数多于3次，或出现扁桃体肥大，影响呼吸，可考虑手术治疗。若每年发作次数小于3次，可选择用药对症治疗，提高身体免疫力。
