慢性扁桃体炎反复发作，可以加强体育锻炼，服用提高免疫力的药物，若效果欠佳，则需行手术治疗。
慢性扁桃体炎反复发作与患者的免疫力低下有关，需要加强体育锻炼，增强体质及抗病能力，减少发病几率。还可酌情服用增强免疫力的药物，如玉屏风散、百令胶囊、胸腺肽肠溶胶囊等。通过应用这些药物可以增强免疫力，防止扁桃体持续受到细菌或病毒感染。
若经过上述治疗之后效果欠佳，慢性扁桃体炎仍然反复发作，或者并发扁桃体周围脓肿，导致扁桃体过度肥大，影响正常呼吸以及吞咽，甚至引起其他脏器病变，比如心肌炎或者肾炎等，需要进行手术治疗，常用的手术方式是低温等离子射频消融术，温度较低，止血效果比较好，术后恢复较快。通过手术可以将病变的扁桃体切除，彻底杜绝扁桃体炎反复发作。
