女性菌群失调，一般是指阴道菌群失调，大多数不能达到自愈的目的，在阴道内的菌群平衡被破坏后，则会造成女性出现阴道炎症疾病，比如细菌性阴道炎、霉菌性阴道炎、滴虫性阴道炎等，需要基于不同的治疗。具体分析如下：
女性在阴道内菌群失调后，很可能会因为有害菌增多，从而出现细菌性阴道炎。对于无症状者不需要特殊治疗，如果女性出现了阴道瘙痒，分泌物增多等表现，可以配合医生选择替硝唑、甲硝唑、克林霉素等药物治疗。
主要是由于阴道内的真菌过度增殖所致，很难达到自愈的目的，如果没有及时治疗，还可能会进一步加重，严重危害患者健康。所以需要配合医生给予抗癫痫药物治疗，常用药物包括克霉唑制剂、咪康唑制剂、制霉菌素制剂等，需遵医嘱用药。
主要是由于阴道内的滴虫过度繁殖所致，局部用药不容易治愈，所以在治疗方面就要选择甲硝唑、替硝唑药物，必要时性伴侣需要一同治疗。
