健康人体中，其肠道会寄居着大量的微生物，这些微生物的种类繁多，各种菌群之间有一定的比例，而且互相依存互相制约，有一定的动态平衡，这就保证了人体肠道的正常和健康。如果因为某一些原因导致了这些菌群的数量、种类出现变化的话，人们的身体也会出现某一些疾病。那么肠道菌群失调鉴别诊断是怎样进行的呢？
1、菌群分析
这是最主要的检查方法，医生会根据患者的肠道分泌物进行检查，看患者的肠道菌群的数量、种类是否与正常人群的菌群有所偏差。
2、定量分析
这是一种很常用的检查方法，把患者的粪便均质、稀释、培养后进行计数，可以检查出患者肠道的菌群数量，再与正常人的数量值进行比较。
3、定性分析
这与一般的微生物检查相同，主要在显微镜下观察患者的粪便中有多少种微生物，如果出现了本不该有的细菌的话，那就说明患者的肠道菌群出现了失调。
4、结肠镜检查
如果患者的肠道菌群失调比较严重且已经出现了肠道病变的话，在结肠镜的观察下医生们可以看到肠粘膜出现了水肿、弥漫性充血、血管分支模糊等现象，有的肠粘膜已经开始溃烂，并有黄色假膜附着。
