HPV42阳性时还能接种HPV疫苗，一般不影响HPV疫苗的接种效果，需根据年龄选择适合自己的HPV疫苗接种。
HPV疫苗是预防宫颈癌的疫苗，目前有二价HPV疫苗、四价HPV疫苗和九价HPV疫苗三种类型。其中二价HPV疫苗涵盖HPV16、HPV18两种病毒，适合9-45岁的女性接种。四价HPV疫苗涵盖HPV6、HPV11、HPV16、HPV18四种病毒，适合20-45岁的女性接种。九价HPV疫苗涵盖HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV45、HPV52、HPV58等多种病毒，适合16-26岁的女性接种。在接种HPV疫苗时，即使感染了某种类型的HPV，只要不在HPV涵盖的范围内就可正常接种。
HPV42是低危型HPV，持续感染时可能会诱发尖锐湿疣，并不会导致宫颈癌出现，也不是三种HPV疫苗的涵盖范围内，即使HPV42阳性也可接种HPV疫苗。但要注意HPV疫苗只是预防HPV入侵，并不能对抗HPV感染，所以HPV42阳性者接种了HPV疫苗后还需定期复查，了解HPV是否转阴。如HPV持续不转阴，需积极应用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素溶液、重组人干扰素α-2b注射液等等药物对抗病毒，促使HPV尽快转阴。具体用药需遵医嘱，不可擅自用药。
