健康的妇女阴道分泌物可分离出20多种微生物。阴道中主要的常住菌有乳酸杆菌、表皮葡萄球菌、大肠杆菌、B群链球菌、类杆菌、白色念珠菌、支原体等。乳酸杆菌在阴道清洁中起着主要作用。用阴道分泌物直接涂层染色，根据革兰阳性乳酸杆菌的百分比，阴道可分为不同的清洁度，I度视野多为乳酸杆菌，ii度约为50%，ii度不超过50%。正常情况下，菌群和机体处于共生状态，不引起疾病，机体正常防御功能受损引起内源性感染。
有些女性生殖系统本来就很健康，但是经常用中药外洗剂、高锰酸钾溶液等消毒剂洗阴道和外阴，想预防妇科疾病的发生。事实上，这种做法可能会导致不良后果。这是因为阴道有自洁的作用，可以在一定程度上保护妇女的生殖系统。如果没有用药指征，自己用消毒剂清洗阴道，可能会破坏阴道的防御功能。此外，经常使用中药洗剂和高锰酸钾清洗外阴也可以降低外阴皮肤的抗病能力。经常使用高锰酸钾也能减少皮肤油脂，皮肤干燥，引起外阴瘙痒。
在日常生活中，加强自我保护意识，养成良好的卫生习惯，注意小节，往往对预防妇科疾病起到事半功倍的作用。例如，不要在公共浴室乱放衣服，洗外阴，洗内衣后再洗脚，不要和别人换衣服，特别是洗内衣的阴部盆栽，毛巾必须专用，毛巾必须定期煮沸消毒，患手足癣的女性必须尽早治疗，否则容易引起真菌性阴道炎
