根据临床特点和实验室检查，结合阳性家族史，一般可对地中海贫血作出诊断。有条件时，可以进行基因诊断。地中海贫血应与以下疾病鉴别。
1.缺铁性贫血轻型地中海贫血的临床表现和红细胞的形态变化与缺铁性贫血相似，容易被误诊。但缺铁性贫血常有缺铁诱因，血清铁蛋白含量减少，骨髓外铁粒幼红细胞减少，红细胞游离原叶琳升高，铁剂治疗有效等资金鉴别。
2.传染性肝炎或肝硬化 因HbH病贫血较轻，还伴有肝脾肿大、黄疽，少数病例还可有肝功能损害，故易被误诊为黄疽型肝炎或肝硬化。但是，通过病史询问、家庭调查、红细胞形态观察、血红蛋白电泳检查可以识别。
