1、造血组织损伤
除BLM和VCR(一般剂量)外，所有药物对造血组织有一定程度的损伤，如CTX、消肿芥末(AT1258)、MMC、ADM、5-FU等。骨髓受到严重抑制的人，需要多次输给新鲜血。
2、消化系统损伤
各种药物有不同程度的反应，如恶心、呕吐、食欲不振、腹痛、腹泻等症状。5-FU、ADM、BLM等容易出现口腔粘膜溃疡，5-FU经常腹泻，VCR容易引起便秘和肠瘫。
3、泌尿系统损害
CTX、IFO容易引起膀胱炎，DDP对肾小管、肾小球有损害，可引起肾衰竭，大量用药时应水化。
4、神经系统损害
VCR、DDP具有周围神经毒性，DDP可造成耳神经损害。
5、心肺系统损害
BLM可引起肺纤维化，ADM总剂量大于550mg/m2时，心脏毒性反应明显。
