癌胚抗原检测结果正常也可能患癌。根据目前的医学水平，没有发现任何物质对所有类型的癌症都有一定的敏感度。癌胚抗原也是如此，仅对结肠癌、食道癌、乳腺癌、腺癌、腺癌、肺癌、胃癌、胆管癌等实体肿瘤具有较高的敏感度。其他类型的癌症，即使发展得比较严重，也不会刺激身体分泌癌胚抗原。
人体中癌胚抗原大部分由肿瘤细胞分泌，少部分由胃肠上皮细胞、肝细胞、胰细胞分泌。通常，人体分泌产生的癌胚抗原和稳定癌细胞分泌的癌胚抗原经胃肠道代谢，破坏生理活性后，再次吸收或排出体外。但是，在肿瘤细胞活跃的状态下发生的癌胚抗原活性强，浓度上升，超过人体胃肠代谢能力，大量癌胚抗原进入淋巴、血液循环。根据此时的血样检查，癌胚抗原指数大幅上升。取常态血样检查，癌胚抗原可能在正常范围内。
即癌胚抗原正常，只表示患者在此期间体内癌细胞和癌细胞活性低。人体的正常细胞受细菌、病毒、支原体感染的刺激，受激素变动的影响，机体无法提供稳定的环境时也有变成肿瘤细胞的可能性。因此，癌胚抗原的正常性并不意味着患者体内没有肿瘤，也不意味着没有癌症。
值得注意的是，癌胚抗原异常也不意味着患者患癌，癌胚抗原上升的诱因很多，因此癌胚抗原只有癌症的确认、识别才有参考价值。癌胚抗原的应用价值是衡量患者肿瘤手术后的身体恢复状况，防止癌症复发。同样，这种效果也只针对以上几种癌症，因为癌胚抗原对其他类型的癌症不敏感，正确反应患者的身体状况。
