原发病人积极治疗原发病。治疗单纯性便秘是改善饮食内容，补充水分和含纤维素多的食物(谷物、蔬菜等)。同时训练排便习惯。药物治疗只在必要时临时使用。
1、人乳喂养婴儿的饮食矫正
人乳喂养婴儿很少便秘。发生的情况下，除了喂人乳之外，还要加入加糖的菜水和橙汁(用新鲜的橙汁挤压，市场上销售的橙汁打开瓶子容易污染)、番茄汁、山楂和枣汁。4个月以上可加入菜泥或煮熟的水果泥。母乳不足时，可加1-2次加8%糖的牛乳。蜂蜜水每日60～90ml，也有帮助。
2、人工喂养婴儿的饮食矫正
人工喂养儿较易便秘，但如合理加糖及辅食，可避免便秘。如果发生，可以将牛奶中的糖增加到8%，并添加果汁(如番茄汁、橙汁、菠萝汁、枣汁和其他煮果汁)来刺激肠蠕动。大较大的婴儿可以加入蔬菜泥、蔬菜末、水果、粥类等品。再大一些可加较粗的谷类食物如玉米粉、小米、麦片等制成粥。1~2岁，加入各种辅食，每天牛奶量500ml就足够了，可以多吃粗粮食、红薯、胡萝卜和蔬菜。有条件者可加琼脂果冻。营养不良的儿童便秘，要注意补充营养，逐渐增加入量，营养状况好转后，腹肌、肠肌增长、张力增加，排便自然顺畅。
3、训练习惯
大便是反射性运动，儿童通过训练可以养成按时排便的习惯。一般来说，3个月以上的婴儿可以开始训练，早上喂奶后用大人的双手支撑，坐在盆里或排便椅子上，按时执行半到一个月就能养成习惯。培养后不要随意改变时间。对于年长的慢性便秘，除了鼓励多运动、纤维多的食物外，还要按时通便，养成良好的习惯。
4、中医治疗
中医认为慢性便秘多系津亏肠燥所致，治以滋阴润肠法。轻者可以使用单味郁李仁，每次咀嚼3~5粒，每天1~2次，或者每隔一天服用。重者经常经常用三仁丸(瓜菜仁、郁李仁、火麻仁各等量制作密丸，每丸3g)每次1丸，每天1~2次，幼儿减半。老年人可以服用麻仁滋脾丸，每天1~2丸，通便后停止服用。
5、其他疗法
幼儿每晚睡觉前可以服用镁乳，每次0.5~1ml/kg，或者液状石蜡每次0.5ml/kg，也可以用两种药制成合剂，不仅仅是石蜡油，肛门也容易泄漏。以上药物连续3~5天，第二天早上可以训练大便。为了避免吸入，婴儿不使用蜡油。儿童也可以使用苯酚每次3毫克/公斤，睡前穿。急性便秘和粪块堵塞，可以用开塞露(甘油和山梨酒精制剂)5~10ml注入肛门，刺激直肠排便的家庭可以用肥皂条插入婴儿的肛门排便，也可以用小指戴上皮手套涂上少量的石蜡油和凡士林，插入肛门排便。灌肠的方法刺激性强，容易养成习惯，非特殊需要时不采用。
