主要与其他小细胞低色素性贫血进行鉴别。
1.珠蛋白生成障碍性贫血（地中海贫血），常有家族史，血片中可见大部分靶红细胞，血红电泳中可见胎儿血红蛋白（HbF）或血红蛋白A2（HbA2）增加。患者血清铁和转铁蛋白饱和度、骨髓染铁增加。
2.慢性病贫血清铁下降，但总铁的结合力不增加或下降，转铁蛋白饱和度正常或略增加。血清铁蛋白经常增加。骨髓中铁粒幼细胞数量减少，巨食细胞内铁粒和含铁血黄素粒明显增加。
3.铁粒幼细胞性贫血在床上很少见。老年人容易出发。主要是因为铁的利用障碍。经常是小细胞正色素性贫血。血清铁增高，总铁结合力正常，转铁蛋白饱和度增高。骨髓中铁粒和铁粒幼细胞明显增加，可见许多环状铁粒幼细胞。血清铁蛋白的水平也越来越高。
