但目前自我移植不是绝对安全的，术后初期可能发生疼痛、瘀伤、血肿、感染等并发症，术后1~3个月内可能发生色素沉着、移植量过多或不足、移植区等。更严重的可能是脂肪栓塞引起的突然失明或偏瘫，甚至死亡。以下是面部自体脂肪移植的各种并发症的简要介绍。
1、感染、血肿
脸部脂肪移植手术如丰唇、丰颊等可引起感染。原因可能与手术方法有关，或者手术区域感染或移植量过大。感染和血肿直接影响移植脂肪的成活率，达不到预期的手术效果。
2、脂肪填充不足
相关统计显示，面部脂肪移植有3%~14%的不满率，其中一部分原因是在通常移植次数后填充量无法满足患者的要求。移植脂肪吸收过多，移植效果难以预测的问题，一直是自体脂肪移植的难点。
3、脂肪填充过剩
脂肪填充过剩表现为手术区域的膨胀，可能是对称的，也可能是单侧的手术后，手术后3~6个月出现，丰颊手术最常见。
4、脂肪栓塞
据相关文献报道，自1980年脂肪移植以来，有8例面部脂肪移植术后脂肪栓塞并发症。其中1例死亡，4例脑梗死伴失明，2例失明，1例脑梗死。发生情况少但结果严重，是自体脂肪移植最严重的并发症。
5、脂肪移动
手术后脂肪成活前，移植的脂肪组织可能会移位。多发生在皮下瘢痕组织过多的部位和韧带分布区(鼻唇沟部等)。
6、脂肪液化或结节形成
脸部脂肪移植术后发生皮下结节的，偶尔会有报道。
7、手术操作不慎损伤其他组织
因手术操作问题，可能损伤手术区血管、神经等组织。
