如果男性在有风险的性接触后出现红斑、水泡、脓疱和阴茎上出现红斑、水泡、脓疱和溃疡，并伴有疼痛和灼烧感，应怀疑他们可能患有生殖器疱疹。如果水泡和溃疡反复出现在同一部位，可能是生殖器疱疹的复发。
生殖器疱疹的男性和女性在早期阶段有不同的表现。如果女性有不洁的性交史，然后在大阴唇、小阴唇、阴道口和肛门周围出现水泡、溃疡和疼痛，并伴有白带增多和脓性白带，则应考虑患生殖器疱疹。女性无反映的病毒伏击感染比男性更常见，是主要感染源。
生殖器疱疹的男性和女性在早期阶段有不同的表现。男性生殖器感染病毒后，大约一半的人没有任何不适，不知道自己生病了，但病毒已经伏击并可能感染；给别人。
由于单纯疱疹病毒在人体内没有持久的免疫力，当生殖器疱疹患者的抗病能力下降时，如发热性感染、胃肠功能障碍、月经、妊娠、病变感染、过度疲劳、情绪环境变化等。单纯疱疹病毒-1主要导致唇疱疹、咽炎、角膜结膜炎和散发性脑炎，而单纯疱疹病毒-2主要导致生殖器疱疹，但临床情况相反。
单纯疱疹病毒感染的埋伏期为1-45天，平均为6天。单纯疱疹病毒-1感染主要发生在皮肤粘膜的交界处，如口角、唇缘、鼻孔等。也可以看到面部或嘴唇。一开始有灼痒感和轻微紧张感，偶尔伴有神经痛，然后出现红斑，在红斑的基础上出现簇状丘疹，迅速变成小米到绿豆大小的水泡。
