新生儿腹泻一般可以使用药物治疗。
婴儿出现拉肚子的症状，首先可以服用蒙脱石散进行止泻，效果比较好。比较常见的是由于新生儿肚子受凉或者吃奶不规律所诱发的胃肠功能紊乱，就会出现拉肚子的症状，同时可以配合服用益生菌调节胃肠道菌群失衡，能够有效地改善拉肚子，益生菌有金双歧等。如果新生儿在拉肚子的过程中出现身体发热，甚至是高热，有可能是由各种致病菌侵害消化系统所引起的急性肠胃炎，会出现不同程度的水、电解质、酸碱平衡紊乱，所以要对症处理，给予抗生素和纠正水、电解质平衡，预防脱水，纠正脱水。医生主要根据病史和临床表现，结合粪便培养、血气和血电解质测定进行诊断。在诊断过程中，应与鼠伤寒沙门氏菌腹泻、致病性大肠杆菌腹泻、真菌性肠炎等疾病相鉴别。细菌性腹泻早期粪便培养阳性率较高，怀疑有脓毒症或别的部位感染的，应及时进行相应的检查、培养和药敏试验。粪便涂片可用于病毒性腹泻，电子显微镜可发现病毒颗粒。病程3～4d阳性率最高。或双血清病毒抗体检测和快速病毒抗原检测更为明显，并在2～3周达到峰值。真菌性腹泻的粪便镜检可见真菌孢子和菌丝，粪便真菌培养结果呈阳性。
在腹泻急性期暂时禁食，以减轻胃肠道负担，恢复消化功能。轻度腹泻只需减少牛奶量，严重呕吐和腹泻者暂时禁止挤奶。禁乳时间不宜过长，一般为8~12小时，然后开始喂食，最好喂母乳。
