卵巢巧克力囊肿可不是因为巧克力吃多了而跑到卵巢当中去了，它是子宫内膜异位症的一种表现。卵巢巧克力囊肿也会有癌变的可能。
有数据表明，卵巢巧克力囊肿约有1%的恶变率。虽然手术治疗可对卵巢巧克力囊肿恶变进行清除，但是如果患者在患病之后能够早发现早治疗，避免因自身原因使卵巢巧克力囊肿的病程增长，导致卵巢巧克力囊肿的性质产生变化，应该比卵巢巧克力囊肿发生改变后再进行治疗有意义的多，因此一旦患上了卵巢巧克力囊肿，需要定期检查，确认囊肿是否有增大恶变的迹象，这种定期检查随访可能需要伴随患者终生。
治疗卵巢巧克力囊肿并非易事，因其受内分泌功能的控制，所以只要卵巢存在激素的分泌就不会停止，而内膜异位的现象也会一直在进行中，所以卵巢巧克力囊肿疾病是治好了也非常容易复发。有的人就说了，切除卵巢不就可以彻底根治了吗？但是这种杀鸡取卵的做法，严重的影响到了女性朋友的生活质量。所以如果是较小的囊肿，在不影响受孕的前提下进行随诊观察就可以了，但是如果卵巢巧克力囊肿的直径已经超过了四厘米，则必须进行手术，因为继续在增大的囊肿，随时都有“爆炸”的危险。
