1、取卵造成的副损伤
①膀胱损伤，患者可出现血尿，通常通过留置尿管，进行膀胱清洗，达到止血的目的。
②偶尔穿刺肠管或盆腔内血管。
③卵巢出血:少数情况下穿刺的卵巢持续出血，有时需要腹部止血。
④盆腔感染
2、卵巢扭转
促排卵治疗导致多个卵泡生长，或取卵后形成多个黄体囊肿，使卵巢明显增大，此时女性活动过度或改变姿势过快时，卵巢扭转。患者突然出现剧烈腹痛，伴有恶心、呕吐，扭曲的卵巢不能立即复位，可能需要手术治疗，严重时需要手术切除坏死卵巢。
3、多胎妊娠
由于多个胚胎移植到子宫，IVF技术引起的多胎妊娠率明显高于自然妊娠，约为25-30%。多胎妊娠晚期流产和早产的风险显著高于单胎妊娠，母亲患妊娠期糖尿病、妊娠期高血压病、发生难产和产后出血的风险显著增加。因此，多胎妊娠对母儿都不利。现在很多IVF中心为了降低多胎妊娠率，开始减少移植胚胎数量，或者进行单胚胎移植。对于三胎或三胎以上妊娠者，必须进行减胎，而对于双胎妊娠者，建议患者减胎。
4、宫外孕
一般人群宫外孕的发生率为1%-2、5%。IVF将胚胎移植到子宫内，但由于输卵管倾斜因子对胚胎的影响，胚胎流入输卵管内，在输卵管内着床发育，引起异位妊娠。有时胚胎也会种植在宫颈等部位。因此，接受IVF治疗不能防止异位妊娠的发生，相反接受IVF治疗的女性异位妊娠的发生率比普通人高2%-4%。
5、卵巢过度刺激综合征
由于多个卵泡生长，体内因素发生变化，血管内的液体泄漏到腹腔，甚至胸腔内，引起胸腹水。发生率约为10%。许多人症状轻，腹胀、腹部不适、轻度恶心，可以不处理，但少数人出现严重腹胀、尿少、腹痛、纳差，甚至出现胸闷、气短等症状，需要给予静脉补液，住院治疗。不足1%的人可能会出现血栓或肾衰竭。
