一、卵巢肿瘤
浆膜下子宫肌瘤和实质性卵巢瘤、囊性变性和囊性卵巢瘤、张力大或卵巢瘤与子宫粘连，鉴别困难。详细询问月经史和腹部肿块生长速度（恶性卵巢瘤较快），并仔细进行妇科检查。对腹壁紧张的妇科检查不满意的，可使用麻醉药物或止痛剂进行检查。检查包括肛门诊断，注意子宫体是否能与肿块分离，并用子宫探针测量子宫腔的长度和方向。分析综合病史和检查。肌肉注射催产素10单位，注射后肿块收缩为子宫肌瘤，否则为卵巢肿瘤。在大多数情况下，B超显象检查可以区分。但有些必须在手术中确诊。
二、宫内妊娠
怀孕前三个月，个别孕妇仍有少量出血，如误认为月经正常，子宫增大，常误诊为肌瘤。应详细询问以往的月经史（包括数量）、是否有生育史、年龄（年轻肌瘤的机会较少）；还应注意是否有妊娠反应。如果是怀孕，子宫增大符合月经减少的月份；肌瘤患者子宫硬。此外，孕妇的外阴和阴道呈紫蓝色，宫颈柔软，乳房肿胀，乳晕外有次晕。妊娠4个月后，可感觉胎动或听到胎心音，用手触摸子宫收缩。除病史、体征外，还可进行妊娠试验或B超检查。
过期流产伴有不规则阴道出血，尿妊娠试验呈阴性反应，易误诊为子宫肌瘤。但过期流产者有更年期史，有妊娠反应，子宫形态正常。B超检查，一般可以诊断。必要时，可以进行刮痕识别。
子宫肌瘤可合并妊娠，也必须认为，否则或漏诊妊娠或误诊为葡萄胎。过去，如果发现肌瘤，目前有早孕史和体征，而子宫大于更年期，无阴道出血，妊娠试验呈阳性，则诊断无困难。但过去未确诊的人应详细询问月经是否过多，是否有不孕史。检查时注意子宫是否有肌瘤突出，必要时密切观察。如果是葡萄胎，更年期后经常会有少量阴道出血，而腹部肿块在短时间内生长，妊娠试验呈阳性，滴定度高；B超声检查葡萄胎呈雪片状独特波形。
三、子宫腺肌病
半数以上的子宫腺肌病妇女伴有严重的继发性渐进性痛经，常有原发性或继发性不孕。但妊娠子宫很少超过2~3个月。在子宫外伴有子宫内膜异位症的情况下，有时会在后穹顶接触到疼痛小结节。此外，还可以尝试用黄体酮治疗，观察其效果，以识别。但子宫肌瘤合并子宫腺肌病者也不少见，约占肌瘤的10%左右。C超检更有利于鉴别。在手术切除标本的病理学检查中，其他无症状或B超未发现的患者往往可以明确。
四、子宫肥大
这种疾病也导致月经过多，子宫增大，容易与小壁间肌瘤或宫内粘膜下肌瘤混淆。然而，子宫肥大通常有多产史，子宫增大均匀，无不均匀结节，子宫增大通常怀孕约2个月，检测子宫腔无变形，无肿块。B肌瘤结节在超检。
