细菌性结膜炎可能复发，过敏性结膜炎与病毒性结膜炎在再次接触致敏物或身体抵抗力下降时可再次发作。
急性结膜炎可能复发。病因不同，复发几率不同。细菌性结膜炎治愈后复发几率不大，若是病毒性结膜炎，由于病毒在体内潜伏，身体抵抗力下降后，可导致病毒重新繁殖，易复发。过敏性结膜炎由眼部皮肤与黏膜对致敏物可产生过敏反应，再次接触致敏物时，可导致复发。
急性结膜炎复发，若因病毒感染引起，可选择类固醇眼药水滴眼，可减轻症状。若是细菌引起结膜炎，可使用抗生素眼药水或眼药膏治疗，必要时可口服或静脉输注抗生素。
