胎儿畸形可诱发先天性心脏病、多指畸形、唇腭裂、神经管缺陷等疾病，不同疾病引起的后遗症有所不同。
1、先天性心脏病
先天性心脏病较为严重，可分为多种类型，不同类型治疗效果不同，预后也不一样，有部分先天性心脏疾病，尽早手术愈合较好，不会遗留后遗症，而有部分心脏病，致死率较高。
2、多指（趾）畸形
多指（趾）畸形虽然外观异样，但是手指、脚趾等正常功能未受影响，通过矫正手术，术后效果良好，不会遗留后遗症。
3、唇腭裂
唇腭裂不仅会影响外观，即便是通过手术矫正外观正常，但是说话口齿不清。
4、神经管缺陷
神经管缺陷主要包括脑积水、无脑儿、脊柱链等患儿，这类疾病预后较差，患儿生存率极低。即便是正常存活，也伴有智力障碍、行走障碍等。
