作为耳部感染并发症的脑脓肿在发病率上逐年降低，尤其是在发展中国家。相反，来自于鼻窦感染的脑脓肿正在成为威胁成人和儿童健康的重要危险因素。
枪弹伤(Bullet wounds)能导致组织坏死，并遗留金属碎片于脑内，这些碎片有可能成为感染源。其它和脑脓肿相关的异物包括：进入眼球中的铅笔头和草坪飞镖(lawn dart)。此类患者在脑损伤多年后脑脓肿才可能会形成。另外，脑脓肿偶尔可能会源自于面部创伤。
脑脓肿同样也可能是神经外科操作的并发症。外科手术后脑脓肿的发展有可能延迟发生。文献报道中有2例前庭神经鞘瘤术后，1例是在术后3个月形成脑脓肿，另1例则是在术后15个月因为癫痫发作而被发现脑脓肿。
血源播散(Hematogenous spread)— 和菌血症(bacteremia)有关的脑脓肿通常会导致大脑中动脉分布区的多发脓肿。脓肿通常位于灰白质交界处，该处的微小梗死能破坏血脑屏障。
能导致血源性种植的感染包括：
●慢性肺部感染，例如肺脓肿和脓胸，见于支气管扩张的患者或囊性纤维化的患者。
●皮肤感染;
●盆腔感染;
●腹腔内感染;
●食管扩张症和内镜下食管静脉曲张硬化剂注射;
●细菌性心内膜炎(2~4%的患者会并发脑脓肿);
●紫绀型先天性心脏病(通常为儿童);
●肺内右向左分流;
●邻近区域的直接播散常会导致单发的脑脓肿。直接传播之大脑皮层的原发性病灶包括亚急性和慢性的中耳炎(otitis media)和乳突炎(播散至颞叶下部和小脑)，额窦或筛窦炎(播散至额叶)，牙齿感染(通常至额叶)。
