卵巢囊肿手术要根据患者的实际情况来决定是否需要进行，这主要是和囊肿的大小有关，对于比较小的囊肿，还是推荐保守治疗方法，而不是马上进行卵巢囊肿手术。
宫内膜异位症的病灶发生在卵巢上亦可形成囊肿，因囊肿内含有暗褐色粘糊状陈旧血，似巧克力，故也称卵巢巧克力囊肿，它通常表现为痛经，随着每次月经来潮，囊肿内血液逐渐增加，囊肿逐渐增大，有时甚至破裂。卵巢囊肿有虽不是肿瘤，但由于有痛经亦影响生育，患者常常很痛苦，故一旦怀疑卵巢囊肿，宜尽早就医药物治疗及卵巢囊肿手术。
卵巢肿瘤分良性与恶性，良性肿瘤通常表现为单侧囊肿、活动、表面光、生长缓慢。恶性肿瘤表现为双侧性或单侧性，实性或囊实性，表面高低不平，但有时良恶性肿瘤在临床上很难区分，必须手术后经病理检查才能最后区分，所以一旦怀疑为肿瘤宜尽早进行卵巢囊肿手术。
以上情况就是需要卵巢囊肿手术的时机，虽然卵巢囊肿是一般都是良性的，不会造成患者很大的痛苦，但是介于卵巢囊肿对女性不孕的重大影响以及较大的癌变几率，还是需要多加关注卵巢囊肿手术的。
