在做肠胃镜时会存在轻微的不适，大多数都可以忍受，但由于每个人对疼痛的敏感度不同，因此会存在个体差异。
因为在做肠胃镜时，操作比较简单，首先需要口服导泄类药物，将肠道内的垃圾排出体外，保持干净的情况下，在将电子镜软管通过口腔插入胃内，在通过影像学传送到电脑上，能够用来判断胃内是否存在病变等问题，比如胃溃疡、胃部息肉以及恶性肿瘤等。
一般在进行检查时对肠道并不会造成太大的刺激，因此并不会产生明显的疼痛感，只是在插入软管的过程中会对喉咙造成不适的感觉，但大多数都可以忍受，不需要特殊处理。如果特殊患者对疼痛敏感度比较高，可以在医生的指导下进行无痛肠胃镜检查。
建议患者不用过于担心，保持良好的心态，听从医生的安排，配合治疗，并不会造成太大影响。
