微生态调节剂，是供口服或经其他黏膜途径投入的含活菌和(或)死菌(包括组分和产物)的微生物制剂。具有调解和改善肠道微生物和酶的平衡，刺激特异性和非特异性免疫的作用，用以增进健康、防治疾病。
目前可供选择的微生态调节剂有数十种，根据他们的来源和不同组成成分可做以下区分和选择：来源于食品的有发酵食品如酸奶，来源于保健品的如昂立1号，来源于药品的如整肠生、培菲康等。作为药品使用的微生态调节剂按成分不同分为益生菌、益生元和合生元三大类。
益生菌是人体的有益菌，含有活菌或死菌(菌体成分及代谢成分)，有液态和固态的，经口服或其他黏膜给药，可改善菌群失衡状态。益生元是一种不被人体消化的食物成分，在肠道能选择性地刺激有益菌生长、繁殖，增进宿主健康，如寡聚糖等促进双歧杆菌生长的因子，合生元是益生菌与益生元的组合制剂，也有再加入维生素、微量元素的，我国也有加入中草药的。
具体可选择的微生态制剂有由单一活菌制剂做成的乳酶生、丽珠肠乐胶囊(含双歧杆菌)、整肠生胶囊/颗粒剂(含地衣芽胞杆菌)、米雅颗粒(含酪酸梭状芽胞杆菌)、肠复康(含蜡样芽胞杆菌)、亿活粉或胶囊(含冻干活布拉德酵母菌)、舒畅宁片、定君生胶囊(含乳酸杆菌)等。
死菌或细菌代谢产物制剂有乐托尔散剂或胶囊(含热处理的嗜酸乳酸杆菌及其代谢产物)、乳酸菌素片(含以鲜牛奶为原料提取的促进有益菌生长的物质)；多菌种微生态制剂如培菲康、金双歧、普乐拜尔、威特四联活菌片、聚克、美常安等。
虽然临床上应用微生态调节剂是安全的，到目前为止还没有因过量使用而发生不良事件的报告，但由于其作用的专一性较差，使用时应选择合适的适应证。同时对制品的选择上应对其性能、质量、效果作充分了解。
应用时需注意几个问题：
①判定是否存在菌群失调和确定严重程度。
②原则上不要同时使用抗生素，重症患者不能停用抗生索时，需加大微生态调节剂的用量。
③同时注意要提高患者机体全身免疫力。对腹泻病人应了解有无水电解质失调及低蛋白血症，若有应作相应的处理，对频繁水样泻而肠道无明显炎症的患者，应酌情给予收敛剂，对长期慢性腹泻者应尽量针对病因处理，同时可合用增强免疫力的中西药。
④活菌效果最好，复合菌种比单菌种效果好，但不是菌数越多越好。在选择微生态调节剂治疗肠道菌群失调时，全面细致的考虑方能取得良好的治疗效果。
