幽门螺杆菌是一种能在胃酸的强酸环境中生存的细菌，能造成胃黏膜屏障的破坏。慢性萎缩性胃炎与这种细菌感染有密切的关系，感染幽门螺杆菌者更易发生慢性萎缩性胃炎，因此，对于合并幽门螺杆菌感染者，要根治这种细菌感染。慢性萎缩性胃炎患者应常规检查HP，有的地方检查血清中的HP抗体，有的地方检查碳13呼气试验。如果合并有HP感染，应采用四联疗法根治HP，同时对症治疗。在治疗4周后复查碳13呼气试验。
慢性萎缩性胃炎合并肠上皮化生，目前经常称之为癌前病变，发生胃癌的可能性比非萎缩性胃炎不合并肠上皮化生的人要高一些。针对这类人群，应该结合饮食，HP根治，及中药综合治疗，尽可能使萎缩性胃炎转为非萎缩性胃炎，减少肠上皮化生的程度。
异型增生又名上皮内瘤变，是典型的癌前病变，分为低级别上皮内瘤变与高级别上皮内瘤变。慢性萎缩性胃炎常合并肠化生，少数出现上皮内瘤变，经历长期的演变后少数病例可发展为胃癌；低级别上皮内瘤变大部分可逆转而较少恶变为胃癌。
胃是一个比较容易受伤的器官，如何有出血性疾病，或者用很多的大量的抗凝药物，一旦出现胃黏膜的严重糜烂，可能容易出现大出血，而大出血是致命性的，所以，有严重出血倾向的慢性胃炎，也是高风险的类型。
