女性肾感染的原因，主要是细菌从膀胱上行感染肾脏导致的，和女性的尿道解剖特点关系密切，也可能是因为不注意个人卫生造成的。
女性发生肾感染，通常与尿道解剖特点有关。女性的尿道短、宽、直，细菌容易逆行进入尿道以及膀胱当中，还会继续上行感染，经输尿管到达肾脏。常见的是细菌感染，如大肠杆菌、粪肠球菌、葡萄球菌、绿脓杆菌等，极少数是由真菌、病毒或者其他微生物感染引起的。
女性的肛门以及生殖器距离尿道非常近，如果平时不注意这两个部位的清洁，容易出现相互感染。肛门以及生殖器部位的细菌会进入尿道当中，细菌上行后会进入肾脏当中造成肾脏感染。若平时不注意会阴部的清洁卫生，无法做到每日清洗，内裤也不能经常换洗，或者大便后有不良的擦拭习惯，也会给细菌逆行感染提供可乘之机。
