引起肾积水的原因有先天性因素，包括肌肉发育不全、输尿管狭窄、输尿管高位开口，也有可能是后天性因素引起的，比如膀胱输尿管回流、输尿管或肾盂肿瘤息肉。
一、引起肾积水的先天性因素
1.肌肉发育不全：如果肾盂输尿管交界处或者是上段的输尿管，出现了阶段性肌肉发育不全等情况，那么这一段的输尿管正常蠕动就会受到影响，从而产生动力性梗阻。如果这种病变是发生在输尿管膀胱入口处，可能会形成先天性巨输尿管，进而导致肾积水，还有肾脏、输尿管扩张的情况。
2.输尿管狭窄：如果存在输尿管狭窄的情况，也容易导致肾积水。这种情况大多发生在肾盂和输尿管交界处，狭窄部位的长度通常是在1~2毫米之间，这样容易产生不完全梗阻和继发性扭曲。长了肌肉细胞会被破坏，从而形成以胶原纤维为主的无弹性狭窄段，对尿液的传送造成阻碍，最终形成肾积水。
3.输尿管高位开口：输尿管高位开口是导致肾积水比较常见的先天性因素之一，这种情况有可能是肾盂周围纤维化，或者是膀胱输尿管回流引起。
二、引起肾积水的后天性因素
1.膀胱输尿管回流：如果某些原因导致了膀胱输尿管回流，容易造成输尿管扭曲的现象，再加上输尿管周围发生了纤维化，很容易形成肾盂输尿管交界处或输尿管梗阻的情况，此时可能会引发肾积水。
2.输尿管或肾盂肿瘤息肉：如果患有输尿管或肾盂部位的肿瘤性疾病或者是吸入性疾病，也容易导致输尿管出现梗阻现象，时间长了会发生肾积水。
