九岁孩子半夜发烧39摄氏度的处理办法有药物退热、物理降温、寻找病因等，具体情况如下：
如果家中备有退热药物，首选口服退热药物，常用的有布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚等等，如果有复方锌布颗粒也是可以的。
采取物理降温的方法，用温毛巾擦拭患儿的腋窝、腘窝、肘窝、腹股沟等皮肤褶皱处，或者洗温水浴都可以帮助降温。
退热的同时应尽快去医院就诊，寻找病因，针对病因使用抗病毒、病菌药物治疗，才能从根本上解决问题。此外还应注意多喝温开水，促进机体代谢等等。
