大三阳主要治疗目的就是促使HBeAg（乙型肝炎E抗原）转阴，并产生e抗体，使体内的病毒停止复制。虽然目前还没有能够彻底消灭乙肝大三阳病毒的特效药物，但抗病毒的药物还是很多的，如干扰素、无环鸟苷、拉米夫定等可以试用，同时积极关注最新技术方法，及时治疗。
当然，最重要的是要提高个人的免疫功能和抗病毒能力，一方面使自身有能力消除乙肝病毒，另一方面保持目前乙肝病毒的携带状态不再发病。
