发生牙周炎应早期治疗，因为其预后与病变严重程度有关。
牙周炎治疗分四阶段：第一阶段为基础治疗阶段，目的在于选用牙周病常规的治疗方法，清除或控制临床炎症和咬致病因素，包括口腔自洁，拔除预后差和不利修复的牙，龈上洁治，龈下刮治以清除菌斑，牙石，选用抗菌药控制炎症，咬颌调整等，第二阶段为牙周手术治疗和松动牙固定，第三阶段为永久性修复治疗，一般手术后2-3个月后进行，第四阶段为复查治疗段，每半年一次，包括检查菌斑控制情况，卫生宣教，拍片检查，以进一步拟订治疗计划。
牙周治疗成功与否关键有两点：一是周密的治疗计划和医生细致，精湛的治疗，二是病人坚持良好的自我菌斑控制。后者比前者更重要。否则，医生的工作会加倍，疾病也会再次发生。
