引起肠梗阻的原因分为机械性和非机械性两种。易于理解，机械性肠梗阻是指肠道堵塞，其原因有三种情况：肠道本身的病变、肠道外挤压和肠道内异物堵塞。
细分后，肠道本身的病变可以是先天性(如闭锁、狭窄、发育不全)、炎症性(如克罗恩病、细菌性和放射性小肠炎)、肿瘤(原发或转移、恶性或良性)、肠套叠等，肠道外压迫可以是疝(内、外疝)、粘连、先天性条索、扭转、肿块压迫(肿瘤、脓肿、血肿、变异血管)
非机械性肠梗阻为神经肌肉障碍，包括麻痹性肠梗阻、肠段神经节不足(如巨结肠症)；另一个是血管闭塞，如动脉或静脉。
有趣的是，不同的国家地区和不同年代，不同原因引起的肠梗阻的发生率不同。总体趋势是嵌顿性外疝引起的相对下降，继发性腹内粘连相对上升。
